大きい病院、いわゆる大病院とは病床規模が500床以上の病院であり、中病院とは病床規模が100床以上499床以下の病院を意味します。ただし医療法において大病院・中病院との区別はなく、20床以上は病院とだけ定義され、19床以下は診療所と定義されます。ただし、保険診療の値段を決める診療報酬では、病院の規模による区別があります。
| 病院名 | 病床数 | 住所 | 電話 |
| 長崎医療センター | 643 | 長崎県大村市久原2-1001-1 | 0957-52-3121 |
| 佐世保市総合医療センター | 594 | 長崎県佐世保市平瀬町9-3 | 0956-24-1515 |
| 光仁会病院 | 557 | 長崎県長崎市三原3-643 | 095-844-3456 |
| 長崎みなとメディカルセンター | 513 | 長崎県長崎市新地町6-39 | 095-822-3251 |
| 佐世保共済病院 | 413 | 長崎県佐世保市島地町10-17 | 0956-22-5136 |
| 長崎労災病院 | 350 | 長崎県佐世保市瀬戸越2-12-5 | 0956-49-2191 |
| 諫早総合病院 | 323 | 長崎県諫早市永昌東町24-1 | 0957-22-1380 |
| 長崎原爆病院 | 315 | 長崎県長崎市茂里町3-15 | 095-847-1511 |
| 佐世保中央病院 | 312 | 長崎県佐世保市大和町15 | 0956-33-7151 |
| サンレモリハビリ病院 | 310 | 長崎県佐世保市江上町4848-1 | 0956-58-5900 |
| 長崎記念病院 | 304 | 長崎県長崎市深堀町1-11-54 | 095-871-1515 |
| 長崎川棚医療センター | 285 | 長崎県東彼杵郡川棚町下組郷2005-1 | 0956-82-3121 |
| 長崎病院 | 280 | 長崎県長崎市桜木町6-41 | 095-823-2261 |
| 長崎県対馬病院 | 275 | 長崎県対馬市美津島町鶏知乙1168-7 | 0920-54-7111 |
| 愛野記念病院 | 234 | 長崎県雲仙市愛野町甲3838-1 | 0957-36-0015 |
| 三原台病院 | 232 | 長崎県長崎市三原1-8-35 | 095-846-8111 |
| 済生会長崎病院 | 205 | 長崎県長崎市片渕2-5-1 | 095-826-9236 |
| 十善会病院 | 193 | 長崎県長崎市籠町7-18 | 095-821-1214 |
| 北松中央病院 | 189 | 長崎県佐世保市江迎町赤坂299 | 0956-65-3101 |
| 長崎県上五島病院 | 186 | 長崎県南松浦郡新上五島町青方郷1549-11 | 0959-52-3000 |
| 清水病院 | 181 | 長崎県西彼杵郡時津町浜田郷572 | 095-882-1225 |
| 田上病院 | 161 | 長崎県長崎市田上2-14-15 | 0958-26-8186 |
| 長崎百合野病院 | 160 | 長崎県西彼杵郡時津町元村郷1155-2 | 095-857-3366 |
| 宮崎病院 | 153 | 長崎県諫早市久山町1575-1 | 0957-25-4800 |
| 虹が丘病院 | 150 | 長崎県長崎市虹が丘町1-1 | 095-856-1112 |
| 長崎リハビリテーション病院 | 143 | 長崎県長崎市銀屋町4-11 | 095-818-2002 |
| 長崎掖済会病院 | 142 | 長崎県長崎市樺島町5-16 | 095-824-0610 |
| 青洲会病院 | 124 | 長崎県平戸市田平町山内免612-4 | 0950-57-2155 |
| 長崎北徳洲会病院 | 108 | 長崎県長崎市滑石1-12-5 | 095-857-3000 |